روش ضد عفونی در این دستگاه گرچه می تواند با استفاده از محلول های شیمیایی باشد، اما تقریبا در همه آن ها از طریق ضدعفونی حرارتی یا Thermal انجام می شود.

برای شستشوی وسایل و ابزار پزشکی، آزمایشگاهی و مشابه، دو روش وجود دارد: دستی یا Manual و خودکار یا Automatic

هدف استفاده از پایش فیزیکی، شیمیایی، و بیولوژیک این است که اطمینان از صحت فرآیند استریلیزاسیون و استریلیتی وسایل و مواد به دست آید، پس باید به قضاوت و گزارش آن ها توجه کرد و علت نقص را کشف کرد.

تصمیم و قضاوت در مورد این که یک وسیله یا ماده باید استریل شود، بر عهده افراد فعال در آن حوزه خاص است.

پایش یک استریلایزر شامل سه قسمت پایش فیزیکی، پایش شیمیایی، و پایش بیولوژیک است.

برای استریل کردن ابزار و وسایل، پس از پاکسازی آن ها، نوبت به بسته بندی می رسد.